基因组指纹图可以明确显示出乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌和胃癌对治疗的反应如何。
胃癌对现有的各种治疗方法均反应欠佳，是目前世界上第三大癌症死亡原因（仅次于肺癌和肝癌）。研究人员发现，目前用来治疗乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌的某些药物也可以被用来治疗某些特定基因变异模式（基因组分子指纹）的胃癌。
最新研究表明，一种被称为3号的特定基因组分子指纹图，与存在有缺陷的DNA修复机制的细胞有关，例如由于缺陷BRCA1基因或BRCA2基因的存在，诱发乳腺癌。包含有3号特定基因组分子指纹图的癌细胞存在的缺陷会使得它们无法有效修复受损DNA。由于无法修复DNA损伤，这些细胞变得对铂类药物和聚腺苷二磷酸-核糖聚合酶（PARP）抑制剂等药物易感，DNA受到药物攻击而被瓦解。之后，由于DNA损伤无法修复，癌细胞就会死亡。
因此，3号可以预测哪些癌症有可能对特定的药物治疗有反应。最初只在一些乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌患者体内发现3号的存在，后来还在其他癌症患者体内发现3号，在这项最新研究中，研究人员旨在找出哪些癌症含有对治疗药物敏感的这种标志物。
“我们对10,250例患者的癌症基因组进行了分析，对36种不同类型的肿瘤进行了大规模的计算筛选，在每个样本中寻找3号的模式。我们不仅证实了相当一部分乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌患者的基因组存在3号，我们还发现，大约有10%的胃癌患者存在这种分子指纹，”该研究的通讯作者，来自美国洛斯阿拉莫斯国家实验室的奥本海默研究员Ludmil Alexandrov博士说道。“这一类胃癌很可能具有缺陷DNA损伤-修复机制，因此，可能会对现有的治疗方法（如铂类药物或PARP抑制剂药物）敏感。”
